3.3版QSAR软件具有的新功能或新特性有：
增加了由P&G公司开发的作为节点特异性分析器的DART（发育和生殖毒性）模型；
l 实现了节点在二维图上关联的可能；
l 增加了毒性数据库（ToxCastDB）；
l 在QSAR整个工作流里实现了存储功能；
l #p#分页标题#e#实现了在数据缺口填充时用测量的数据过滤化学物质的功能。
此外，QSAR 3.3也更新了包括ECHA CHEM在内的6个数据库和用于爆炸特性和光毒性计算的QSAR模型，同时也修改了一些故障并进行了其他一些使用上的完善。QSAR 3.3的输出功能目前已经能与IUCLID 5.6的最新版兼容。
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